Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSD1Q9BTV5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSD1Q9BTV5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSD1Q9BTV5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSD1Q9BTV5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSD1Q9BTV5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms