Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG101Q9BSB4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms