Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms