Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms