Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms