Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NSMCE2Q96MF7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms