Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms