Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC97Q96F63 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms