Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms