Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms