Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX20Q7Z614 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX20Q7Z614 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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