Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms