Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms