Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TBC1D3CQ6IPX1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms