Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM78BQ5VT40 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM78BQ5VT40 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM78BQ5VT40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM78BQ5VT40 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM78BQ5VT40 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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