Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC27A3Q5K4L6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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