Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms