Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FGD3Q5JSP0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms