Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM16LQ309B1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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