Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms