Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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