Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB1Q16531 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB1Q16531 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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