Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRY1Q16526 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms