Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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