Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ATP6AP1Q15904 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ATP6AP1Q15904 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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