Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms