Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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