Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
R3HDM1Q15032 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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