Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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