Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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