Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms