Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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SHROOM2Q13796 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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SHROOM2Q13796 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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SHROOM2Q13796 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
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