Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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