Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMB3Q13751 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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