Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms