Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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