Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms