Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CALCOCO2Q13137 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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