Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PTPN13Q12923 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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