Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms