Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms