Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms