Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE3AQ05086 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms