Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC6Q03468 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms