Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms