Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms