Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms