Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms