Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHDQ02161 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms