Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms